Minha resolução, alterei o quantidadeCarbono2 por quantidadeCarbonoFinal | JavaScript e HTML: desenvolva um jogo e pratique lógica de programação

<!DOCTYPE html>
<meta charset="UTF-8">
<body>
    <hr>
<title>CARBON</title>
</body>
<style>
    body { background-color: #c1c1c1

     }
 </style>
<body>
<h1>Medidor de Carbono</h1>
<hr>
</body>


<script>

    function pulaLinha() {
        document.write("<br>");
    }

    function mostra(frase) {
        document.write(frase);
        pulaLinha();
    }

    var quantidadeCarbono1 = parseInt(prompt("Quantidade de carbono substância 1"));
    var quantidadeCarbono2 = parseInt(prompt("Quantidade de carbono substância 2"));

    quantidadeCarbono2 = quantidadeCarbono2 + 2;

document.write("<h1>" + "O resultado das substâncias concentradas de carbono é: " + "</h1>");

    if(quantidadeCarbono1 == quantidadeCarbono2 ) {

        mostra("<h3>" + "Acho que são substâncias parecidas" + "</h3>");
    } else {

        mostra("<h3>" + "<hr>" + "São substâncias bem diferentes" + "</h3>");
    }

</script>