Minha resolução;

No meu código fiz um if dentro da função desenhaCirculo pra corrigir a posição, funcionou e também poderia ser corrigida por cores.length!

<canvas width="600" height="400"></canvas>

<script>
    var tela = document.querySelector('canvas');
    var pincel = tela.getContext('2d');
    pincel.fillStyle = 'grey';
    pincel.fillRect(0, 0, 600, 400);
    cores = ['blue','red', 'green'];
    posicao = 0;

    function desenhaCirculo(evento) {
        if(posicao == 3) {
            posicao = 0;
        }

        var x = evento.pageX - tela.offsetLeft;
        var y = evento.pageY - tela.offsetTop;
        pincel.fillStyle = cores[posicao];
        pincel.beginPath();
        pincel.arc(x, y, 10, 0, 2 * 3.14);
        pincel.fill();
        console.log(x + ',' + y);
    }


    tela.onclick = desenhaCirculo;

    function mudaCor() {

        posicao++;
        return false;
    }


    tela.oncontextmenu = mudaCor;


</script>