Solucionado
A partir do login de um cliente que já tem cadastro é possível permitir que o meu usuário marque produtos que ele deseja ou add em um favorito e dessa forma mostrar uma lista para ele? Gostaria também se dessa forma eu consigo dar sugestões de compras ou kits para aquele usuário logado?
Opa Leandro, nativamente não, mas existem diversas apps do Shopify que fazem isso :)
Dá uma olhada aqui: https://apps.shopify.com/search/query?utf8=%E2%9C%93&q=wishlist
Aliás, esse é o grande barato do Shopify. Se não tiver algo que você queira, provavelmente alguém já fez uma app e se for muito específico, você consegue estendê-lo.