Solucionado
O primeiro curso que fiz de Java foi com o Netbeans. Eu vejo nesse curso de agora o metodo main sendo incluso em varias classes. O Netbeans procura pelo main nas classes do projeto e se tiver dois mains, ele nao compila. Isso quer dizer que com o Eclipse posso ter metodos main em varias classes, mas porque eu teria o main em mais de uma classe?
Não uso NetBeans, mas se você clicar com o botão direito em uma das classes, deve aparecer a opção "Run..." ou algo assim. Se pesquisar um pouco, deve haver uma opção de como selecionar uma classe main padrão (default).
Independente da IDE (Eclipse, NetBeans ou Intellij) não é comum ter mais de uma main no mesmo código. Na prática, você pode utilizar mais de uma main para testar o código parcialmente em mains diferentes. Por exemplo: testar manualmente uma parte do código (utilizando System.out.println) em uma main e outra funcionalidade em outra main. Mas no final das contas uma aplicação trabalha apenas com uma main.