Quando você fala "Com isso, as categorias já estarão organizadas de outra maneira no navegador:" após colocar estilo no .destaques__categorias___lista você demonstra o posicionamento dos itens já com o flex-wrap funcionando, sendo que só após aplicar estilo no item de { width: 50% } que isso será possível, afinal ele ocupará 50% duas vezes e cairá para baixo por conta do wrap :)
Seria massa arrumar isso lá, gera bastante confusão :)
