Concordo com você Fernanda!
A metodologia ágil pode não se encaixar em todos os departamentos. Um exemplo disso são departamentos que precisam seguir etapas operacionais com requisitos muito específicos. Nesse caso, o método waterfall seria o mais ideal. Contudo, acredito que ainda é necessário que haja uma integração e comunicação ágil entre os departamentos, porque um setor influencia, direta ou indiretamente nos processos de outra área. Respeitando as singularidades de cada área, uma mesma empresa pode adotar a metodologia ágil em um departamento específicio e manter uma postura mais tradicional em outros, desde que seja estabelicido um fluxo de integração e conciliação entre os setores.