Fala, Gabriel! Tudo bem? Como vai?
Quando nós fazemos uma instalação via apt -get "só " podemos desinstalar pelo apt -get e caso instale através do dpkg também "somente" poderá desinstalar através do dpkg.
Isso em teoria, Gabriel!!!
Existe um gerenciador de pacotes chamado Synaptic que pode te ajudar na questão de saber as origens dos seus pacotes instalados no sistema e também realizar outras funções como possíveis atualizações e tudo mais!!!
Agora, o que está vindo no mercado como facilitador é o Snappy. Esse também é um gerenciador de pacotes porém vem com a proposta de "unificar" essa questão de instalações via apt -get ou dpkg. Isso vai facilitar muito para quem já é aconstumado com o método de instalação do Windows e deseja migrar para Linux. O Spotify, por exemplo, já indica que a instalação seja feita por ele.Peço que dê uma pesquisada sobre.
Bom, Gabriel, espero ter contribuído com o aprendizado!!!
Bons estudos e vamos em frente!!!