Bom dia Adriana, ^^
Entendi agora, Como você criou os elementos dentro do proprio after os grupos que existiam no arquivo vetorial do professor não estão organizados na camada, e de fato não é possível criar um grupo de objetos da mesma forma que o AI.
Você pode criar pré-composições, é semelhante ao grupo mas por ser o After effects são composições. Você seleciona os hexagonos que você quer agrupar, aperta o botao direito e clica em pré-compose (ou você pode selecionar e apertar CTRL + SHIFT + C também.) e ir criando pré-composições com os objetos agrupados e assim organizar suas camadas ok.
Dentro da pré-composição (basta dar dois cliques rapidos no icone dela) você consegue selecionar cada um dos hexagonos individualmente. Para fazer a animação do mesmo você vai acessar a propriedade de content do objeto.
Clica na camada do hexagono, vai na setinha ao lado pra baixar as propriedades, em vez de animar o transform você vai em contents e ali dentro você trabalha com a propriedade transform, os valores de opacidade e escala.
E respondendo uma coisa lá do início do tópico, nenhuma pergunta é boba ok ^^, se você tiver dificuldade em fazer este processo que comentei ou não resolver seu problema avise aqui de novo, se possível eu faço um vídeo, mas a gente vai achar uma solução =D
Um abraço e bons estudos pra ti :)
