Veja se isso pode te ajudar:
O git clone, faz o clone do último estado comitado do servidor. Se alterações foram feitas no servidor, como por exemplo adicionar arquivos ou modificações, você precisar commitar isso para atualizar (avançar) o estado do servidor. Após isso você faz um git pull das informações novas na cópia da ana, isso vai buscar essas novas alterações e atualizar a cópia local para ficar novamente no mesmo estado do servidor.
SERVIDOR: ---|commit1|---|commit2|---|commit3|---|estado atual|
CLONE (ANA): ---|commit1|---|commit2|---|commit3|---|estado atual|
NOVO COMMIT NO SERVIDOR: ---|commit1|---|commit2|---|commit3|---|commit4|---|estado atual|
ANA: ---|commit1|---|commit2|---|commit3|---|estado atrasado|
SERVIDOR: ---|commit1|---|commit2|---|commit3|---|commit4|---|estado atual|
PULL(ANA): ---|commit1|---|commit2|---|commit3|---|commit4|---|estado atual|
resumindo, caso queira clonar com as novas alterações, garanta que tudo foi commitado no servidor antes de realizar o clone (enquanto não forem commitadas no servidor, é como se não houvessem acontecido) - se já tiver clonado, apenas commite no servidor e depois atualize ana usando o pull.
Suerte!