Eu vendo alguns produtos que são pesados demais (ou grandes demais) para os Correios, sendo preciso o uso de transportadora.
1- Quais as soluções possíveis nesta situação?
2- Existe como automatizar o cálculo do frete com transportadoras?
3- Posso além do frete com transportadora, oferecer uma opção do tipo "combinar com o vendedor"?
Oi Paulo, tudo bom? Respondendo suas questões:
1 e 2) Provavelmente há uma regra ou forma de cálculo do valor do frete com suas transportadoras, certo? Tendo essa regra, você pode criar o seu próprio plugin de cálculo de valor do frete, através de uma API: https://help.shopify.com/api/reference/carrierservice
3) Formalmente não há essa opção, mas você pode improvisar. Você pode deixar o aviso de "combine o frete com o vendedor" nas telas e no checkout e após a compra você entra em contato com ele e envia a cobrança do frete pelo PayPal, pagSeguro ou outra forma.
Mas não acho que seja a solução ideal.