Olá Pedro, como está?
Por padrão, quando você recebe um valor digitado pelo usuário, mesmo que seja um número o javascript armazena ele como uma String, então quando você tenta soma-los o que acontece é que eles acabam sendo concatenados (Isso não ocorre com outras operações, pois quando o compilador vê um sinal aritmético diferente de soma ele já entende que são números.).
Para resolver seu problema você precisa converter a leitura do prompt pra tipo numérico dessa forma:
var numero1 = parseInt(prompt("Olá, informe um número:"));
var numero2 = parseInt(prompt("Agora informe outro número:"));
Abraços e qualquer dúvida continue postando.