Acho que a única coisa que você pode melhorar é colocar a pulaLinha(), dentro da função mostra. Assim, você não precisaria chamar tantas vezes o pulaLinha().
<meta charset="UTF-8">
<script>
function pulaLinha() {
document.write("<br><br>");
}
function mostra(resposta){
document.write(resposta);
pulaLinha();
}
var dif;
var paulo;
var matheus;
paulo = 20;
matheus = 13;
difIdade = paulo - matheus;
mostra("A idade de Paulo é " + paulo);
mostra("A idade de Matheus é " + matheus);
mostra("A diferença entre as idades é " + (difIdade));
</script>
insira seu código aqui