Oii, Fernando! Tudo bem?
Uma possibilidade é que, ao aplicar o filtro, a linha de totais esteja sendo afetada porque ela não está incluída no intervalo que você selecionou para aplicar o filtro. O Excel considera apenas as linhas que estão dentro do intervalo filtrado.
Então revise o conteúdo que está incluso no intervalo que você está filtrando. E, também, o congelamento de painéis, a linha de totais está congelada? Caso não esteja ela pode sumir. Outra dica é limpar todos os filtros e veja se a linha de totais reaparece.
Verifique esses pontos e refaça o passo a passo, espero que dê certinho!
Bons estudos, Fernando!