Uma dica que me ajudou a fazer o Bootstrap funcionar, sem precisar tocar no arquivo angular.json e setar os caminhos de estilo e script foi fazer os seguintes passos:
npm install bootstrap@4.1.1
Esse é como foi feito na aula. Depois eu rodei:
npm install
Que aí ele meio que configura as suas dependências de novo certinho e tudo fica ok.