Solucionado (ver solução)
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fatal: this operation must be run in a work tree

alan in /media/Projetos/servidor at fox ❯ git init --bare Initialized empty Git repository in /media/Projetos/servidor/ fatal: this operation must be run in a work tree

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solução!

Já vi o que tinha feito de errado, estava faltando executar o git init antes.