De alguma forma a aplicação não está reconhecendo a classe Funcionario, inclusive quando baixei o código compartilhado pelo professor pra rodar e fazer o teste.

O erro acusado está no arquivo, bonificacoes, nessa parte do código:

$umFuncionario = new Desenvolvedor(
    'Rodrigo Matos',
    new CPF('123.456.789-10'),
    'Desenvolvedor',
    '1000'
);

Obs:. Antes de implementar as classes Gerente, Diretor e Desenvolvedor o código rodou, quando implementei a classe Gerente passou a acusar esse erro...

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Código do arquivo Bonificacoes

<?php

require_once 'autoload.php';

//Importa as classes
use Alura\Banco\Service\ControladorDeBonificacoes;
use Alura\Banco\Modelo\CPF;
use Alura\Banco\Modelo\Funcionario\{Desenvolvedor, Gerente, Diretor};

// O construtor feito no modelo Funcionario tem como parametros, Nome, CPF, Cargo e Salario
$umFuncionario = new Desenvolvedor(
    'Rodrigo Matos',
    new CPF('123.456.789-10'),
    'Desenvolvedor',
    '1000'
);

$umFuncionario->sobeDeNivel();

$umaFuncionaria = new Gerente(
    'Andrea Matos',
    new CPF('123.456.789-11'),
    'Gerente',
    '3000'
);

$umDiretor = new Diretor(
    'Andrea Matos',
    new CPF('123.456.789-12'),
    'Diretor',
    '5000'
);

$controlador = new ControladorDeBonificacoes;
$controlador->adicionaBonificacaoDE($umFuncionario);
$controlador->adicionaBonificacaoDE($umaFuncionaria);
$controlador->adicionaBonificacaoDE($umDiretor);

echo $controlador->recuperaTotal();

Código do arquivo Funcionario

<?php

namespace Alura\Banco\Modelo\Funcionario;
use Alura\Banco\Modelo\{CPF, Pessoa};

// o comando extends estende a classe pessoa para o arquivo atual
abstract class Funcionario extends Pessoa
{
    private $cargo;
    private $salario;

    public function __construct(string $nome, CPF $cpf, string $cargo, float $salario)
    {
    // a função parent:: faz referencia uma classe "mãe/Pai" chamada pessoa
        parent::__construct($nome, $cpf);
        $this->cargo = $cargo;
        $this->salario = $salario;
    }

    public function recuperaCargo(): string
    {
        return $this->cargo;
    }

    public function alteraNome(string $nome): void
    {
        $this->validaNomeTitular($nome);
        $this->nome = $nome;
    }

    public function recebeAumento(float $valorAumento): void
    {
        if($valorAumento < 0){
            echo "O aumento deve ser positivo";
            return;
        }

        $this->salario =+ $valorAumento;

    }

    //Geter para recuperar o salário
    public function recuperaSalario(): float
    {
        return $this->salario;
    }

    // Geter para recuperar calculo da bonificação
    public function calculaBonificacao(): float
    {
        return $this->salario * 0.1;
    }
}

Código do arquivo Gerente

<?php

namespace Alura\Banco\Modelo\Funcionario;

class Gerente extends Funcionario
{
        // Geter para recuperar calculo da bonificação
        public function calculaBonificacao(): float
        {
                return $this->recuperaSalario();
        }
}

Código do arquivo Diretor

<?php

namespace Alura\Banco\Modelo\Funcionario;

class Diretor extends Funcionario
{
        // Geter para recuperar calculo da bonificação
        public function calculaBonificacao(): float
        {
                return $this->recuperaSalario() * 2;
        }
        // Permissão de autenticação
        public function podeAutenticar(string $senha): bool
        {
            return $senha === '1234';
        }
}

Código do arquivo Desenvolvedor

<?php

namespace Alura\Banco\Modelo\Funcionario;

class Desenvolvedor extends Funcionario
{
    public function sobeDeNivel(): float
    {
        $this->recebeAumento($this->recuperaSalario() * 0.75);
    }
}

Código do arquivo controladorDeBonificacoes

<?php

namespace Alura\Banco\Service;

use Alura\Banco\Modelo\Funcionario\Funcionario;

class ControladorDeBonificacoes
{
    private $totalBonificacoes = 0;

    public function adicionaBonificacaoDe(Funcionario $funcionario)
    {
        $this->$totalBonificacoes += $funcionario->calculaBonificacao();
    }

    // Geter para recuperar o total da bonificação
    public function recuperaTotal(): float
    {
        return $this->totalBonificacoes;
    }
}