Olá Gabriel! Uma forma de resolver esse seu problema seria utilizar caracteres de escape, que é uma forma de informarmos ao navegador que desejamos escrever um caractere especial. O seu exemplo ficaria assim:
document.write("A tag para pular linha em HTML é < br >");
O navegador então trocaria o "<" pelo sinal de menor que "<" e o ">" pelo sinal de maior que ">" , resultando então em < br >
Essa é uma solução das mais simplistas, mas com certeza você encontrará outras mais sofisticadas.
Espero ter ajudado. Jr.