erro no projeto clonado

Oi Renata o/

Eu olhei sua aplicação, corrigi e fiz um pull-request da correção lá no Github.

Então, esse erro que aparece aí pra você é do Flyway, o gestor de migrations que você está usando, isso significa que tem alguma coisa errada com os arquivos de migration... Veja só...

A sua migration V2 tem erros de sintax:

-- Errado:
alter table vollmed_api add telefone varchar(20) not toNull

-- Correto:
alter table vollmed_api add telefone varchar(20) not null;

A sua query SQL na migration V3 também está errada:

-- Errado:
alter table medicos add ativo timyint
update medicos set ativo = 1;

-- Correto:
alter table medicos add ativo tinyint;
update medicos set ativo = 1;

Nessa V3 além do erro na escrita, você tem duas querys distintas que devem ser executadas separadamente, por isso é importante não esquecer do ; (ponto e vírgula) no final da query SQL, para que elas não sejam consideradas uma coisa só.

Outra coisa que tinha errado também é esse método aqui no seu MedicoController:

    @DeleteMapping("/{id}") // Faltava fechar a chave
    @Transactional
    public void excluir(@PathVariable long id){
        var medico  = repository.getReferenceById(id);
        medico.excluie();
    }

Agora, feitas essas correções, abra o seu MySQL e execute os seguinte comandos:

//seleciona o banco
use vollmed_api;

//exclui a tabela medicos
drop table medicos;

//exlcui a tabela do flyway
drop table flyway_schema_history;

Rode sua aplicação novamente e tudo deve funcionar