Bom dia Paulo, tudo bem ^^
Eu respondi uma pergunta semelhante ontem, não sei ao exato se a resposta se encaixa aqui, mas olha só o que eu comentei no outro post.
Pode estar acontecendo algo relacionado as configurações internas do seu projeto, é muito comum a adobe bloquear algumas opções baseado na profundidade de cor, ou nas dimensões do arquivo, ou até mesmo no formato das cores do arquivo.
No caso do save for web eu sei que que as configurações:
Profundidade de cor se for igual a 32 bits de cor ele desabilita a opção
Tamanho do arquivo se for superior a 30000 pixel ele bloqueia a opção
São as duas configurações mais comuns a bloquearem esta opção de salvar.
Então confira se o seu arquivo não possui dimensões maiores do questas, ou se ele não esta com uma profundidade de cor de 32 bits.
Neste caso em que expliquei o problema o save for web fica transparente, mas já vi casos em que ele fica aplicável e gera o mesmo aviso que esta ocorrendo no seu.
Veja se alguma dessas soluções te ajuda blz.
abraço