Solucionado
É uma boa prática dividir seu código em vários arquivos. Fica mais fácil a manutenabilidade do mesmo por você ou outro desenvolvedor, mas tem se tomar cuidado para que os arquivos façam sentido em existir. Por isso, existe "padrões de projeto". Isso serve não somente no javascript mas em outras linguagens de programação.
Oi Giuliano, como vai?
Isso mesmo! É sempre uma boa prática dividirmos os arquivos em responsabilidades, para garantir o fácil entendimento e manutenabilidade, como você mesmo disse! Um princípio que defende muito isso e é bem utilizado é o Single Responsibility Principle (SRP), que diz que cada módulo, classe ou função de uma aplicação deve ter responsabilidade sobre uma única parte da funcionalidade desse programa.
Continue estudando assim que irá muito longe! Precisando de qualquer ajuda é só postar no fórum que estaremos à disposição, bons estudos =)