O Android deu um up na linguaguem, mas Java ainda é muito utilizado no meio empresarial para o desenvolvimento de sistemas. Onde trabalho prestamos serviço para grandes empresas como Ericsson, Tim, Vivo, etc... e a maioria de seus sistemas são Java.
O JS geralmente é usado em conjunto, mas também está ganhando muito mercado no back-end. Mas acho que empresas muito grandes e conservadoras vão sentir dificuldade em aderir ao JS, eu digo em relação aos frameworks back-end, onde ele pode ser visto como "concorrência".
O PHP, pelo o que eu vejo do MEU dia-a-dia, é mais usado nos sistemas que têm ligação direta aos clientes, como os portais de cliente/atendimento, etc...