Solucionado
Quando uso o Scale para aumentar um lado, aumenta o outro também. Dentro do Object Mode, consigo aumentar a scala somente em uma parte? Pelo Edit Mode eu seleciono a face e aumento ou diminuo só um lado. Há como fazer isso no Object Mode usando o recurso de escala? 
Olá, Paula, como vai?
O Object Mode aplica transformações no objeto inteiro, então qualquer escala que você fizer vai afetar todos os eixos de acordo com o ponto de origem do objeto. Para modificar apenas uma parte do modelo, como você mesmo percebeu, é necessário usar o Edit Mode, onde você pode selecionar vértices, arestas ou faces e escalar apenas a região desejada.
Espero ter ajudado.
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Abraços :)