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Duvida PyCharm

Todo novo projeto PyCharm cria uma pasta venv (library root) gostaria de entender o porque e se está correto pois nas aulas vejo a ausência dessa pasta nos projetos dos professores.

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Oi Jose, tudo bem?

O seu Pycharm deve estar criando um ambiente virtual (venv). A IDE cria essa pasta para isolar as bibliotecas do seu projeto com as bibliotecas utilizadas pelo sistema operacional. Isso ajuda a evitar o conflito das bibliotecas.

Surgiu uma duvida, mais essa pasta faz parte da minha aplicação? notei que quando instalei o Flask mesmo estando na pasta raiz do projeto os arquivos foram parar dentro da pasta venv. está certo isso?

O ambiente virtual é utilizado apenas para isolar as bibliotecas da aplicação do sistema. Mas não prejudica em nada o desenvolvimento.