Olá, Lais, como vai?
No caso do posicionamento dos pins, quando o mesh não está selecionado dentro do efeito Puppet, o Duik pode interpretar outra malha ou recalcular a posição dos pontos. Algo a conferir é se o mesh está selecionado antes de aplicar os pins.
Sobre a visualização da malha, essa opção para mostrar está localizada na parte superior da interface, na barra de ferramentas ao lado da Puppet Pin Tool.
Vou deixar uma imagem marcando onde essa opção aparece para facilitar a identificação. Acima é a checkbox para que a malha seja mostrada, na lateral esquerda é a mesh que deve estar selecionada ao aplicar os pins do Duik.

Espero ter ajudado.
Siga firme nos seus estudos e conte com o fórum sempre que precisar.
Abraços :)
Caso este post tenha lhe ajudado, por favor, marcar como solucionado