Você está vendo a versão anterior da nova experiência da Alura que estamos preparando para você. Em breve, ela ganha uma identidade visual novinha totalmente pensada em potencializar seus estudos!
Andre, também acabei tendo problemas embolando varias pastas e arquivos avulsos ao projeto.
Eu resolvi isso clonando o meu projeto em uma outra pasta. Para evitar que o git rastreie pastas ou arquivos indesejados, basta criar um arquivo .gitignore na mesma pasta em que você tem o seu git e adicionar linhas contendo as pastas e arquivos que ele não deve rastrear, exemplo:
Oi!
Se no seu VSCode não tiver uma pasta de projeto aberta, ao abrir o terminal ele vai apontar para a pasta do seu usuário no computador. Para resolver, basta abrir a pasta do projeto no VSCode (menu superior: File -> Open Folder) e depois de aberto o projeto, abra uma nova janela do terminal (menu superior Terminal -> New terminal)
Bons estudos!