[Dúvida] padding auto

@import url('https://fonts.googleapis.com/css2?family=Anta&display=swap');
@import url('https://fonts.googleapis.com/css2?family=Anta&family=Comic+Neue&display=swap');

:root {
    --cor-primaria: #201658;
    --cor-secundaria: #1D24CA;
    --cor-terciaria: #b7edff;
    --cor-quarta: #fff5e1;
    --cor-border: #00b7ff;

    --fonte-anta: "Anta", sans-serif;
    --fonte-comic: "Comic Neue", cursive;
}
*{ /*reset margem */
    margin: 0;
    padding: 0;
}

body { /* corpo */
    /* height: 100vh; width: 100%; */
    box-sizing: border-box;
    background-color: var(--cor-terciaria);
    color:var(--cor-primaria);

    .apresentacao { /* classe main */
        padding: 3% 11%;
        display: flex;
        justify-content: space-between;
        align-items: center;
        gap: 30px;

    }

    .cabecalho { /* menu header */
        background-color: var(--cor-primaria);
        padding: 2% 11%;
        justify-content: center;
    
        .cabecalho__menu {
            display: flex;
            gap: 4.38rem;
        }
    
        .cabecalho__menu__link {
            color: var(--cor-terciaria);
            font-family: var(--fonte-comic);
            font-size: 1.56rem;
            text-decoration: none;
        }
    }
    
    .apresentacao__conteudo { /* classe section */
        width: 50%;
        display: flex;
        flex-direction: column;
        gap: 1.25rem;
    }
    
    .apresentacao__conteudo__titulo { /* classe titulo */
        font-size: 2.25rem;
        font-family: var(--fonte-anta);
    }
    
    .apresentacao__conteudo__texto { /* classe paragrafo */
        font-size: 1.38rem;
        font-family: var(--fonte-comic);
    }

    .destaque { /* classe strong */
        color: var(--cor-secundaria);
        font-weight: bolder;
    }
    
}   

.apresentacao__links { /* estilo do botao ancora */
    display: flex;
    flex-direction: column;
    justify-content: space-between;
    align-items: center;
    gap: 0.94rem;
 
    
        .apresentacao__links__subtitulo { /* classe subtitulo */
        font-size: 1.3rem;
        font-weight: 25rem;
        font-family: var(--fonte-anta);
        }

        .apresentacao__links__nav {
            /* background-color: rgb(8, 0, 255); */
            display: flex;
            align-items: center;
            justify-content: center;
            gap: 0.63rem;
            color: var(--cor-primaria);
            border: 0.20rem outset var(--cor-secundaria);
            width: 18rem;
            text-align: center;
            border-radius: 1rem;
            font-size: 1.5rem;
            font-family: var(--fonte-anta);
            padding: 1.3% 0;
            text-decoration: none;
        }

        .apresentacao__links__nav:hover {
            background-color: var(--cor-quarta);
            color:var(--cor-secundaria);
            border: 0.25rem outset var(--cor-border);
            font-size: 1.88rem;
        }

       .apresentacao__links__img {
        border: 0.15rem solid var(--cor-secundaria);
        border-radius: 25%;
       }

       .apresentacao__imagem1 {
        width: 50%;
       }
}

.rodape { /* estilo do rodape */
    background-color: var(--cor-quarta);
    text-align: center;
    padding: 1%;

    p {
        color: var(--cor-primaria);
        font-size: 1.13rem;
        font-family: var(--fonte-comic);
        padding: 0.5%;
    }

    span{ /* span feito no nome dos direitos autorais */
        font-weight: bolder;
        color: var(--cor-secundaria);
        font-family: var(--fonte-comic);
        border: 0.16rem solid var(--cor-secundaria);
        padding: 0.30rem;
    }
}

@media (max-width: 1200px) {
    .cabecalho {
        padding: 1%;
    }

    .cabecalho__menu{
        justify-content: center;
    }

    .apresentacao{
        flex-direction: column-reverse;
        padding: 2%;
    }
    .apresentacao__conteudo{
        width: auto;
    }
}

...............

Olá, Vinicius.

Tudo bem?

Isso acontece porque você tem dois padding definidos, um em um tamanho de tela tipo "Desktop" e outro no "Celular" por exemplo. Ai quando você altera para versão "Desktop", ele risca o padding da versão do celular e viceversa, porque só pode valer o estilo correspondente ao "@media" definido para cada tamanho de tela. Faz um teste, quando estiver na versão da tela de "Pc" olha o padding aplicado na versão "Mobile" de "Celular" o padding vai estar riscado.

Espero ter ajudado. Qualquer dúvida manda aqui. Valeu.