[Dúvida] onde adicionar console.logs para saber se tudo está certo?

Olá Estevão! Fiz uma revisão do seu código adicionando alguns console.log() para que você tenha uma espécie de log do seu código. Segue ele:

alert("Boas vindas ao jogo do número secreto");
let numeroSecreto = 5;
//console.log(numeroSecreto);
let chute;
let tentativas = 1;
//enquanto chute não for igual ao n.s.
while (chute != numeroSecreto) {
     chute = prompt("Escolha um número entre 1 e 10");
     // Console log para verificar o número chute
     console.log(`Chute: ${chute}`);
// Se o chute for igual ao número secreto
    if (chute == numeroSecreto) {
        break;  
    } else { 
        if (chute > numeroSecreto) {
            alert(`O número secreto é menor que ${chute}`);
    } else {
            alert(`O número secreto é maior que ${chute}`);
    }
    //tentativas = tentativas +1;
    tentativas++;
    // Console log para verifica a quantidade de tentativas
    console.log(`Número de tentativas atual: ${tentativas}`);
    }
}
let palavraTentativa = tentativas>1 ? 'tentativas' : 'tentativa'
alert(`Isso ai! Você descobriu o número secreto ${numeroSecreto} com ${tentativas}  ${palavraTentativa}.`);
//Console log para informar quando foi acertado o valor
console.log(`Acertou o número secreto: ${numeroSecreto}.`);

Testei esse código e só funcionou com o console.log(Chute: ${chute}); fora de while:

alert("Boas vindas ao jogo do número secreto");
let numeroSecreto = 5;
//console.log(numeroSecreto);
let chute;
let tentativas = 1;
//enquanto chute não for igual ao n.s.
while (chute != numeroSecreto) {
     chute = prompt("Escolha um número entre 1 e 10");
     // Console log para verificar o número chute
     
// Se o chute for igual ao número secreto
    if (chute == numeroSecreto) {
        break;  
    } else { 
        if (chute > numeroSecreto) {
            alert(`O número secreto é menor que ${chute}`);
    } else {
            alert(`O número secreto é maior que ${chute}`);
    }
    //tentativas = tentativas +1;
    tentativas++;
    // Console log para verifica a quantidade de tentativas
    console.log(`Número de tentativas atual: ${tentativas}`);
    }
}
console.log(`Chute: ${chute}`);
let palavraTentativa = tentativas>1 ? 'tentativas' : 'tentativa'
alert(`Isso ai! Você descobriu o número secreto ${numeroSecreto} com ${tentativas}  ${palavraTentativa}.`);
//Console log para informar quando foi acertado o valor
console.log(`Acertou o número secreto: ${numeroSecreto}.`);