Olá Caio!
Analisando essa consulta no meu entendimento o trecho "count (a.id_aluno in (ta.ID_Turma))" não está de acordo com o que o SQL Server espera.
O método count espera a definição de uma coluna para a contagem, por exemplo "count(a.id_aluno)" ou "count(ta.ID_Turma)".
No seu caso me parece que faz mais sentido a consulta ser dessa forma:
select ta.ID_Turma, count (a.id_aluno) Quantidade_Alunos_Por_Turma
from Alunos a
join Turma_Alunos ta
on a.ID_Aluno = ta.ID_Aluno
group by ta.ID_Turma;
Note que ao final da consulta é necessário fazer o agrupamento da coluna "ta.ID_Turma", já que está definida na seleção além da coluna de contagem.
Outra dica é definir um alias para a coluna onde está utilizando a funcão count, facilitando a análise do resultado.
Espero ter ajudado!