Nao compreendi a pergunta. O código que fiz ficou da seguinte forma.
var calculaPontos = function(vitorias, empates){
return (vitorias * 3) + empates;
};
//Prompt sempre devolve texto
var pontos = calculaPontos(parseInt(prompt("Quantos jogos o CDC Futebol Clube venceu?")), parseInt(prompt("Quantos jogos o CDC Futebol Clube empatou?")));
Mas na resposta vi que na solução era bem diferente da que tinha pensado.