Olá!
Se apenas um arquivo está sendo carregado, pode ser uma limitação do próprio GitHub ou do seu navegador.
Pode tentar o seguinte:
Fazer upload diretamente pelo site do GitHub:
Vá até o repositório onde deseja adicionar os arquivos.
Clique em "Add file" > "Upload files".
Arraste e solte todos os arquivos de uma vez.
Clique em "Commit changes".
Usar o Git pelo terminal
Abra o terminal ou Git Bash e navegue até a pasta do seu projeto: cd /caminho/para/sua/pasta
Inicialize o repositório (caso ainda não tenha feito isso): git init
Adicione todos os arquivos: git add .
Faça um commit com uma mensagem: git commit -m "Adicionando arquivos"
Envie para o GitHub (substitua main por master se necessário): git push origin main
Se ainda não tiver configurado um repositório remoto, primeiro conecte ao GitHub: git remote add origin https://github.com/seu-usuario/seu-repositorio.git
E depois envie com: git push -u origin main