Olá, Vitor! Tudo bem?
Como não tenho acesso ao seu projeto, sugiro conferir se você está usando uma biblioteca adequada para trabalhar com geodados, como o shapely
.
Também é importante verificar se as coordenadas do polígono e dos pontos estão no mesmo sistema de referência. Às vezes, os problemas surgem porque um conjunto de dados está em graus decimais e outro em projeções planas.
Uma dica é criar manualmente um polígono e alguns pontos simples para ver se o problema continua.
Espero ter ajudado.
Qualquer dúvida, não hesite em compartilhar no fórum.
Abraços!
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