Boa tarde, Fernando! O problema no seu código ocorre devido à forma como a lógica está estruturada. Quando você usa o else no segundo if, ele está sendo acionado sempre que o número de milhas for inferior a 30.000, o que não corresponde à regra para 30.000 milhas, que deve receber 20% de desconto.

let porcentagemDesconto = 0;
if (quantidadeMilhas >= 30000) {
    porcentagemDesconto = 20; // Se for 30.000 ou mais -> tem 20% de desconto
} else if (quantidadeMilhas >= 5001) {
    porcentagemDesconto = 10; // Se for entre 5.001 e 30.000 -> tem 10% de desconto
}
// Você não precisa de else para o caso de milhas abaixo de 5.000, pois porcentagemDesconto já vai ser 0.

Oi Fernando, boa tarde! Tudo bem?

O problema está na lógica das suas condicionais e nos valores limites. vamos analisar por partes.

let porcentagemDesconto = 0;
 

// Aqui ele está aplicando 10% de desconto se as milhas forem maiores que 5000. 
// Então, caso a quantidade seja 30.000, ele também aplicará o desconto
if (quantidadeMilhas > 5000) { 
    porcentagemDesconto = porcentagemDesconto + 10; 
}

// Aqui ele aplica mais 20% se for maior ou igual a 30.000. 
// Porém, o desconto anterior de 10% pode ter sido aplicado antes, somando com este. 
// Isso resulta em 30% de desconto para 30.000 milhas (Não é o que queremos)!
if (quantidadeMilhas >= 30000) { 
    porcentagemDesconto = porcentagemDesconto + 20; 
} else {
  // Este else sempre será executado quando as milhas forem menores que 30.000.
  // Isso faz com que milhas entre 5.001 e 29.999 recebam 0% de desconto, 
  // mesmo que a primeira condição tenha sido verdadeira.
    porcentagemDesconto = 0; 
} 

O código corrigido:

let quantidadeMilhas = 5000;
let porcentagemDesconto = 0;

// Aqui, primeiro validamos se o valor é maior que 30.000. Caso sim, aplica o desconto de 20%.
if(quantidadeMilhas > 30000) { 
    porcentagemDesconto = porcentagemDesconto + 20;
// Se a primeira condição não for verdadeira, essa é avaliada.
// Aqui validamos se o valor está entre 5.001 e 30.000.
} else if (quantidadeMilhas > 5000) { 
    porcentagemDesconto = porcentagemDesconto + 10; 
} else { 
// Caso nenhuma das condições anteriores seja atendida, aplica-se 0% de desconto.
    porcentagemDesconto = 0; 
}

console.log(porcentagemDesconto);

Lembre-se: o código é executado linha por linha, e a ordem das condicionais altera completamente o resultado!

Dica: sempre use o console.log() para validar e achar erros (o famoso debugar haha). Aqui você poderia aplicar dentro de um if para verificar se o código está passando ou não pela condicional. Por exemplo:

if(condição) { 
    // lógica caso a condição seja favorável
    console.log('passei pela condição!!');
} else {
    // lógica caso não cumpra a condição
    console.log('não passei :(');
}