Solucionado
No caso de utilizarmos o JPA e precisarmos utilizar as notations nos campos da entidade, como é visto isso em relação a clean archtecture? Entendi que nossa entidade jamais ira possuir esse tipo de código específico para uma técnologia, mas como funciona dai?
Oi José,
Seguindo o modelo de clean arch, o ideal seria você isolar a parte de persistência em outro módulo/projeto, sendo que nele você adicionará as entidades JPA.
Aqui tem um projeto em Java de exemplo nesse modelo: https://github.com/rcaneppele/fj91-clean-architecture
Bons estudos!