Oii, Bruno, tudo bem?
Baseado neste tópico, em que o próprio instrutor respondeu, para lidar com o erro, você pode acessar o MySQL, apagar o histórico de migrations e rodar o projeto novamente. Aí o Flyway vai executar as migrations. Basta usar este código:
DELETE FROM flyway_schema_history;
Se a dúvida persistir, estamos aqui.
Abraços! :)