Neste caso se você quiser utilizar o include em uma pasta mais interna que os arquivos que serão incluídos estão, você pode usar
include '../../nome_da_pasta/nome_do_arquivo.php';
Onde cada ../ é um diretório sendo retrocedido.
Já se você estiver numa pasta mais externa, querendo incluir um arquivo de uma pasta mais interna, basta você fazer como o Murilo disse.
Lembrando que quando você trabalha com uma hierarquia de arquivos (onde você faz a chamada de muitos arquivos um dentro do outro), você pode utilizar o include_once que garante que o arquivo será incluído apenas uma vez.