Olá Monica!
No WordPress, uma taxonomia é um mecanismo simples de agrupamento para posts, páginas ou links.
Os campos personalizados são campos extras que você pode inserir na criação de posts no WordPress. Com eles, você pode configurar, especificar e armazenar qualquer tipo de valor e informação. Esta possibilidade é o que torna possível criar temas super personalizados e sistemas mais robustos, como lojas, fóruns, revistas, dentre outros.
Recomendo que você comece seus estudos pelo curso “Curso WordPress I: hospedagem, administração e widgets”, pois ele será uma boa introdução para este curso de criação de temas que você está fazendo.
Espero ter ajudado.