Primeiro no arquivo controladores, dentro da função de deletar está deletaLivroPorId(id) enquanto no arquivo servico está function deletarLivroPorId(id).
Segundo: no arquivo servico o código está escrito: fs.writeFileSync("livros.json", JSON.stringfy(livrosFiltrados)); Enquanto o correto é fs.writeFileSync("livros.json", JSON.stringify(livrosFiltrados));.