Eu modifiquei e deixei desta forma, por enquanto.
package br.com.gilvaneidemedeiros.calculadora;
import java.util.Scanner;
public class Principal {
public static void main(String[] args) {
String nome;
double salario = 0;
int numeroDependentes;
boolean isento = false;
Scanner leitura = new Scanner(System.in);
System.out.println("\nDigite o nome do contribuinte: ");
nome = leitura.nextLine();
System.out.println("\nDigite o salário do contribuinte: ");
salario = leitura.nextDouble();
if (salario <= 2259.20) {
isento = true;
System.out.println("\nContribuinte isento de IRRF!");
System.out.println("\n");
} else {
System.out.println("\nDigite o número de dependentes:");
numeroDependentes = leitura.nextInt();
double irrf = (salario / 100 * 7.5 - (numeroDependentes * 189.59));
if (irrf <= 0) {
System.out.println("\nContribuinte isento de IRRF!");
} else {
System.out.printf("\nO valor do seu IRRF é: %.2f", irrf);
}
System.out.println("\n");
leitura.close();
}
}
}