Eu modifiquei e deixei desta forma, por enquanto.
package br.com.gilvaneidemedeiros.calculadora;
import java.util.Scanner;
public class Principal {
    public static void main(String[] args) {
        String nome;
        double salario = 0;
        int numeroDependentes;
        boolean isento = false;
        Scanner leitura = new Scanner(System.in);
        System.out.println("\nDigite o nome do contribuinte: ");
        nome = leitura.nextLine();
        System.out.println("\nDigite o salário do contribuinte: ");
        salario = leitura.nextDouble();
        if (salario <= 2259.20) {
            isento = true;
            System.out.println("\nContribuinte isento de IRRF!");
            System.out.println("\n");
        } else {
            System.out.println("\nDigite o número de dependentes:");
            numeroDependentes = leitura.nextInt();
            double irrf = (salario / 100 * 7.5 - (numeroDependentes * 189.59));
            if (irrf <= 0) {
                System.out.println("\nContribuinte isento de IRRF!");
            } else {
                System.out.printf("\nO valor do seu IRRF é: %.2f", irrf);
            }
            
            System.out.println("\n");
            leitura.close();
        }
    }
}