Olá, Marcos! Tudo certo?

Analisando o seu código você mandou muito bem, está quase tudo certo e bem organizado. No mais, você esqueceu de usar a variável correta na condição do if. Você declarou idade2 para armazenar a idade que o usuário digita, mas está verificando a variável idade na condição.

Aqui está como você pode corrigir isso:

let nome1 = prompt('Digite o seu nome meu Patrao ou Patroa');
let idade2 = prompt('Digite a sua idade !');

if (idade2 >= 18) {
    alert('Pode tirar a habilitação!');
} else {
    alert('Ainda não pode tirar a habilitação.');
}

Além disso, lembre-se de que o valor retornado pelo prompt é uma string, então é uma boa prática converter idade2 para um número antes de fazer a comparação. Você pode fazer isso usando parseInt ou Number:

let idade2 = parseInt(prompt('Digite a sua idade !'), 10);

Espero ter ajudado e bons estudos!