Solucionado
Consegui o mesmo resultado utilizando null para filtrar a chave dependente. Está correto utilizar também dessa forma? Ou mesmo apresentando um resultado, não seria adequado e pode apresentar resultados inesperados? Obrigado.
db.funcionario.find({"Dependentes": null}, {"_id": 0, "Primeiro_Nome": 1, "Nome_Meio": 1, "Ultimo_Nome": 1})
Olá Leonardo, tudo bem? Foi bem interessante como você realizou essa busca, mas, não é para gerar resultados inesperados, já que mesmo informando na busca como NULL, os documentos que não continham esse campo são retornados normalmente.
Espero ter ajudado e bons estudos!