Oi José, é difícil mesmo dar um número específico para CTR. Depende do site e do termo usado.
O que eu te indico fazer é olhar como está o CTR para as suas palavras chaves principais e ver a evolução delas. O importante é que sempre aumente.
Ou seja, se hoje seu CTR para um determinado termo está em 5%, no mês que vêm, batalhe para ele ficar em 6%. Como? Principalmente fazendo ajustes no meta description, para convencer mais pessoas a entrar. Investindo em microformatos para deixar as informações mais chamativas e interessantes e assim por diante.
Desculpa não dar um número exato. É porque não existe mesmo.