O script não está capitando os dados do form (null) por tanto não criam eles na tela (obs: as tags estão com as classes certas chamadas no script).
var botaoAdicionar = document.querySelector("#adicionar-paciente");
botaoAdicionar.addEventListener("click", function(event) {
event.preventDefault();
var formulario = document.querySelector("#form-adicionar");
var nome = formulario.value.nome; // no debug esta variável está vindo como null
var peso = formulario.value.peso;
var altura = formulario.value.altura;
var gordura = formulario.value.gordura;
var pacienteTr = document.createElement("tr");
var nomeTd = document.createElement("td");
var pesoTd = document.createElement("td");
var alturaTd = document.createElement("td");
var gorduraTd = document.createElement("td");
var imcTd = document.createElement("td");
nomeTd.textContent = nome;
pesoTd.textContent = peso;
alturaTd.textContent = altura;
gorduraTd.textContent = gordura;
pacienteTr.appendChild(nomeTd);
pacienteTr.appendChild(pesoTd);
pacienteTr.appendChild(alturaTd);
pacienteTr.appendChild(gorduraTd);
var tabela = document.querySelector("#tabela-pacientes");
tabela.appendChild(pacienteTr);
});