Eliezer, tudo bem?
Hum.. Entendi. Isso é fácil de resolver.. É só usar o .toLowerCase(). Ele converte tudo o que foi entrado para minusculo. Então independente de usar maiúsculo ou minusculo, ele converte pra minusculo. Mas fique atento! Isso envolve também uma mudança nas condicionais, para identificar somente o resultado minusculo. Fica assim:
<meta charset="UTF-8">
<script>
function jump() {
document.write("<br><br>");
}
function show(frase) {
document.write(frase);
jump();
}
var idade = parseInt(prompt("Qual é sua idade?"));
var temCarteira = prompt("Tem carteira? Responda 'S' ou 'N'").toLowerCase();
if( idade >= 18 && temCarteira == "s") {
show("Pode dirigir");
}
else if( idade >= 18 && temCarteira == "n") {
show("Você é maior, mas não pode dirigir");
}
else {
show("Não pode dirigir");
}
</script>
Espero ter ajudado ^^
Nota: Caso queira saber mais, pesquise sobre métodos de formatação de string. Toda linguagem tem.