Olá, Renato!
Quando você executa o comando sudo ls /root e não vê nenhum arquivo listado, isso pode significar que o diretório /root realmente não contém arquivos visíveis. No entanto, ao usar sudo ls -la /root, você está pedindo para listar todos os arquivos, incluindo os ocultos (aqueles que começam com um ponto), e é por isso que você vê arquivos adicionais.
No Linux, é comum que o diretório /root contenha apenas arquivos de configuração ou diretórios ocultos, especialmente se você não fez nenhuma alteração ou instalação que adicione arquivos visíveis.
Se você está curioso sobre o que mais pode estar no diretório /root, além dos arquivos ocultos, você pode explorar mais usando o comando ls -la como fez, ou até mesmo verificar o espaço em disco com du -sh /root/* para ver se há arquivos que não estão sendo listados por algum motivo.
Bons estudos!