Olá,
No curso foi apresentado como os computadores fazer para "conversar" entre si. No módulo "Acessando o site em nossa simulação", foi apresentado como é feita a comunicação entre um site da internet (no caso o "Google") e o nosso computador. Sendo assim, foi necessário criar um servidor-web e um servidor DNS, simulando uma situação real.
É possível ver no vídeo (5 minutos e 43 segundos) os serviços disponíveis para configuração do servidor.
Em linhas gerais, foi demonstrado como atribuir endereço IP para redes distintas, como o roteamento é feito por meio do equipamento roteador e a utilização do protocolo DNS.
Para serviço de transferência de arquivos, como foi o seu questionamento, há a opção de em vez de criar um servidor-ftp ou tftp. Assim você pode fazer a sua simulação e ver na prática como funciona a comunicação entre eles.
Espero ter ajudado.