Oi Rafael, tudo bem?
No caso específico que você mencionou, a transformação dos valores de entrada não deve afetar o tempo de execução do algoritmo. Isso ocorre porque, independentemente dos valores de entrada, a operação de cálculo da média (que é basicamente uma soma seguida de uma divisão) tem uma complexidade computacional constante. Ou seja, ela leva o mesmo tempo para ser executada, não importa se os números são grandes ou pequenos.
Portanto, se você transformar os valores 10.000 e 10.100 em 0 e 100, respectivamente, calcular a média e depois encontrar o resultado real, o tempo de execução do algoritmo não deve ser significativamente diferente.
Espero ter esclarecido a sua dúvida. Lembre-se que a otimização de algoritmos é um campo complexo e que, às vezes, o que parece ser uma otimização pode não ter o efeito desejado na prática. Por isso, é sempre importante testar e medir o desempenho dos seus algoritmos em diferentes cenários.
Um abraço e bons estudos.