Como se conectar com a instância sem ser utilizando o PuTTY?

Oii, Leonardo, tudo bem por aí?

Você pode usar o terminal do próprio SO (aqui vou dar um exemplo com o Linux ou o macOS). Para isso, você precisará do arquivo com o formato .pem que foi gerado no momento em que você criou a instância EC2 (ele atua como uma public key que usamos no PuTTY, por exemplo).

Agora, vá ao terminal e coloque este comando:

ssh -i /caminho/para/seu/arquivo.pem ubuntu@ip_da_sua_instância

Lembrando que você precisa adaptar para o seu arquivo e caminho, ok?

Se você estiver usando o Windows, uma alternativa é o Git Bash :) depois de instalado, você pode usar o mesmo comando que mencionei acima. Outra solução, também, é usar a própria PowerShell que vem nativamente com o Windows.

Se a dúvida persistir, estamos aqui.

Abraços!