Referente ao curso JavaScript e HTML: pratique lógica com desenhos, animações e um jogo, no capítulo Interagindo com o usuário e atividade Trocando de cor
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Renato, bia tarde!
Você pode salvar em um array cada bolinha desenhada salvando seu x,y e seu raio.
Depois a cada bolinha adicionada, você verifica se ela está dentra da área de uma bolinha desenhada.
Espero ter ajudado e bons estudos!