A altura não é um número inteiro. Você pode converter para Float o prompt referente a altura. Se você fizer este ajuste e informar a altura usando ponto ao invés de virgula (ex: 1.70 ao invés de 1,70), o seu código vai funcionar:
<meta charset="utf-8">
<script>
function calculaImc(altura,peso){
return peso / (altura * altura);
}
var nome=prompt("informe seu nome:");
var alturaInformada = parseFloat(prompt(nome+" informe sua altura"));
var pesoInformado = prompt(nome+" informe seu peso");
var imc = calculaImc(alturaInformada, pesoInformado);
document.write (nome +" , o IMC calculado é de " + imc);
</script>