Fala Nathan blza.
O que está acontecendo é que o prompt quando vc digita um valor ele te retorna um string. Então o método mFamiliar em vez de somar está concatenando os valores.
Ex:
idadeEu = 10, idadePai= 30 , idadeMae=20 o metodo mFamiliar retorna 103020 em vez de somar
Para resolver faz assim, faz um parseInt, você poderia usar Number tbm no lugar de parseInt se fosse trabalhar com valores com casas decimais.
var idadeEu= parseInt(prompt("sua idade"));
var idadePai= parseInt(prompt("idade so seu pai"));
var idadeMae= parseInt(prompt("idade da mae"));